Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms