Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA7P31268 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms