Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFKBIAP25963 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFKBIAP25963 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms