Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2AP24928 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms