Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKCHP24723 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCHP24723 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms