Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TAF1P21675 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1P21675 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1P21675 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF1P21675 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF1P21675 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TAF1P21675 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1P21675 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1P21675 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms