Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA5P20719 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms