Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNB1P20700 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNB1P20700 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms