Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFE3P19532 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFE3P19532 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFE3P19532 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TFE3P19532 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TFE3P19532 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms