Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF7P17544 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATF7P17544 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATF7P17544 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF7P17544 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms