Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF2RAP15509 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms