Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA4P13612 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms