Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC1P11047 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMC1P11047 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms