Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM10L2AP0DMW4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms