Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00869P0C866 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00869P0C866 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms