Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y9

H2AFB1, Histone H2A-Bbd type 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFB1P0C5Y9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2AFB1P0C5Y9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms