Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC175P0C221 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms