Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
F2P00734 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
F2P00734 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2P00734 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2P00734 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2P00734 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2P00734 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
F2P00734 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms