Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX7O95931 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms