Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP19O94966 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP19O94966 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP19O94966 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP19O94966 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP19O94966 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP19O94966 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP19O94966 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP19O94966 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP19O94966 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP19O94966 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP19O94966 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms