Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPM2O94759 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPM2O94759 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms