Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3JO75822 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms