Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAMP4O75379 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAMP4O75379 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms