Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIA2O75334 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms