Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA5O60264 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA5O60264 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms