Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL13O43927 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms