Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYNGR2O43760 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYNGR2O43760 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms