Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBFA2T2O43439 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBFA2T2O43439 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms