Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOCS1O15524 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOCS1O15524 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms