Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR46O15213 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR46O15213 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR46O15213 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR46O15213 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms