Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIMBP2O15034 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIMBP2O15034 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms