Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRTO14522 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
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