Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BQV1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BQV1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H3BQV1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BQV1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BQV1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BQV1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BQV1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BQV1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms