Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E5RI56 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E5RI56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E5RI56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E5RI56 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E5RI56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E5RI56 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
E5RI56 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
E5RI56 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E5RI56 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E5RI56 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms