Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATL2C9JE40 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATL2C9JE40 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms