Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM1B2RUZ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM1B2RUZ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms