Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00587B1AMM8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms