Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms