Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF233A6NK53 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF233A6NK53 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms