Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SERINC4A6NH21 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SERINC4A6NH21 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms