Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms