Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F8A0AVK6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms