Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms