Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U3KQE9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U3KQE9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
U3KQE9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U3KQE9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
U3KQE9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms