Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A3GALT2U3KPV4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms