Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETBP1Q9Y6X0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SETBP1Q9Y6X0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETBP1Q9Y6X0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETBP1Q9Y6X0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms