Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms