Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms