Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX8Q9Y5X2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms