Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX13Q9Y5W8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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